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高通量数据中批次效应的鉴定和处理 - 系列总结和更新

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程（原理、代码和评述）)、DNA甲基化分析...

用R语言做数据分析——重复测量方差分析

重复测量方差分析，是指受试者被测量不止一次。这里重点关注一个组内和一个组间因子的重复测量方差分析。示例来源于生理生态学领域，研究方向是生命系统的生理和生化过程如何响应环境因素的变异。基础安装包中CO2数据集包含了北方和南方牧草类植物的寒冷容忍度研究结果，在某浓度二氧化碳的环境中，对寒带植物与非寒带...

详细数据分析步骤(三)——可视化分析

之前的文章讲述的均为数据的前期处理，然而如今对于数据分析而言，数据的可视化也十分重要。所以这篇文章主要想介绍5种常用可视化图表该怎么用和介绍数据透视表第一部分5种常用可视化图表在进行绘制之前，需要先引入python的两个第三方库importmatplotlib.pyplotaspltim...

大数据:R数据挖掘分析常用包和函数 (收藏)

1、聚类常用的包：fpc，cluster，pvclust，mclust基于划分的方法：kmeans，pam，pamk，clara基于层次的方法：hclust，pvclust，agnes，diana基于模型的方法：mclust基于密度的方法：dbscan基于画图的方法：plot...

Pandas高级教程之:plot画图详解 pandas plotly

简介python中matplotlib是非常重要并且方便的图形化工具，使用matplotlib可以可视化的进行数据分析，今天本文将会详细讲解Pandas中的matplotlib应用。基础画图要想使用matplotlib，我们需要引用它：In[1]:importmatplotlib.pyplot...

R语言数据可视化系列(4)箱线图和小提琴图(附详细代码)

本文希望教会大家运用R语言绘制箱线图和小提琴图。小提琴图能同时查看数据的分布和描述性统计，是一种非常实用的可视化图形。箱线图/盒须图绘制连续型变量常用的五个描述性统计量，从下到上依次是：最小值，下四分位数（25%分位数），中位数（50%分位数），上四分位数（75%分位数），最大值。箱线图能够显示出可...

用R语言做数据分析——数据分布的图形描述

直方图对于数据分布，常用直方图进行描述，将数据取值的范围分成若干区间（一般是等间距的），在等间距的情况下，每个区间的长度称为组距。考察数据落入每一区间的频数与频率，在每个区间上画一个矩形，它的宽度是组距，它的高度可以是频数、频率或频率/组距，在高度是频率/组距的情况下，每一矩形的面积是数据落入区间的...

干货分享 | 推荐一个更高效的数据清洗方法，建议收藏

作者：俊欣来源：关于数据分析与可视化今天来分享一个高效率的数据清洗的方法，毕竟我们平常在工作和生活当中经常会遇到需要去处理杂七杂八的数据集，有一些数据集中有缺失值、有些数据集中有极值、重复值等等。这次用到的数据集样本在文末有获取的办法。01、导入库和读取数据我们首先导入所需要用到的库，并且读取数据i...

时间序列预测教程:如何利用 Python 预测波士顿每月持械抢劫案数量?

编者按：本文是澳大利亚知名机器学习专家JasonBrownlee撰写的教程，极其全面细致，一步步向读者解释如何操作，以及为什么这么做。雷锋网整理编译，特与大家分享。更多AI开发技术文章，请关注AI研习社（微信号：okweiwu）。JasonBrownlee：时间序列预测法是一个过程，而获得良...

生信学习入门常见错误可能的原因分类总结和求助指南

为前文填坑，也希望能给后续答疑积累个素材，有问题先来查询再提问！文件或目录找不到这是常见问题，常见提示有NosuchfileordirectoryErrorinfile(file,“rt”)：无法打开链接Fatalerror:Unabletoopenfileforread...